De twee Top-2000 kerkdiensten die in Woerden, in de laatste week van het jaar worden gehouden, zijn niet hetzelfde. De twee diensten vormen een doorlopend verhaal. Grote animator achter de diensten, dominee Joost Schelling, raadt daarom mensen aan die één van de diensten willen bijwonen, om de andere dienst online te bekijken. Voor de Top-2000 kerkdienst mogen favoriete nummers worden aangegeven maar dat wil volgens Schelling niet zeggen dat ze ook in de kerkdienst te horen zullen zijn. Wel wordt er een overzicht van de 10 meest favoriete nummers bekend gemaakt. De Top-2000 kerkdiensten worden gehouden in de Kruiskerk aan het Mesdagplein in Woerden. Joost Schelling gaat er vanuit dat de kerk beide avonden vol zit. RPL zendt de kerkdiensten op tv rond de jaarwisseling uit.